梓里隧道全长4610米，全隧穿越岩溶、煤层瓦斯、顺层偏压和膨胀岩等不良地质段，甚至可能出现（高压）突水突泥、大变形及坍塌、瓦斯、环境风险等情况，最大涌水量达到72000m3/d，隧道风险等级为极高风险，是铁道部挂牌I级高风险隧道，因此梓里隧道也被看做是影响南涪铁路顺利推进的关键节点。

梓里隧道施工采用从进口、出口和出口平导进行多工作面分段施工。自2008年9月开工建设以来，项目部不等不靠，成立了专门督导小组长期驻守现场，并始终坚持把安全、质量放在首位，对施工方案、资源配置等进行指导，虽多次遇岩溶、突水、突泥、坍塌等情况，但通过制定针对性的施工方案，都能在确保安全、质量的情况下，将工程进度向前顺利推进，直至全隧顺利贯通。